计算机化学研究小组

  计算机辅助创新药物设计平台

Platform for  Drug Design

   为了能在药物设计的各个阶段都提供计算机辅助,我们完成了一系列拥有自主知识产权的药物设计应用软件。与国外软件相比其最大特点是在微机和网络上运行,真正地做到了国内每个课题组都买得起与用得起。选用我们完成的全套软件,以发现新药为目的的课题组都可以从目前 in vitro → in vivo 的药物设计流程向上游扩展成 in silico → in vitro → in vivo
    应用这一创新药物设计平台我们已成功地设计了一系列生物活性先导结构,详细情况可参见:化学学报,57(1999),100-107,108-116;58(2000),529-532,1074-1078,1168-1172和Chinese J. Chem., 17(1999), 237-243。

    需要这一平台的用户可与我们联系。 

 

任务 Task

起始数据 Initial Data

工作内容 Function

ChemLab 软件     Module

   结  果      Result 

文献调研

 

(Literature Retrieval)

化合物结构(Structures)

产生CA索引名

Generation of CA Index Name

CISOC-AGCAIN

CA索引名

CA Index Name

关键词(Key words)

网络自动搜索

Searching in the Internet

ChemSearch

文献目录

List of Literature

未知化合物结构测定与性质计算

 

Identification of Structure & Prediction of Property 

IR, C NMR, H NMR, 2D NMR, MS

结构解析

Structure Elucidation

CISOC-SES

化合物结构

Structure

化合物结构

Structure

IR波谱模拟

Simulation of IR

SIRS-SS

IR谱图

Spectra of IR

C NMR波谱模拟

Simulation of  CNMR

CISOC-SCNMR

C NMR谱图

Spectra of C NMR

H NMR波谱模拟

Simulation of  H NMR

CISOC-HNMR

H NMR谱图

Spectra of H NMR

LogP预测

Prediction of LogP

CISOC-LogP

LogP

LogP

新药研究起点

 

Beginning of  Drug Discovery

由症状基于中
药的药物设计

Symptom

疾病检索

Disease Search

中药创新数据库

TCM Innovative Databases

疾病Disease

中药方剂检索

TCM Prescription Search

中药方剂,单体药,活性化合物

TCM Prescription,
Medicinal Herb, Bioactive Compounds

疾病

Diseases

药物检索

Drug Search

药物数据库

Drug Database

药物名、活性化合物结构Drug Name, Structure of Bioactive Compound

 

中药创新数据库

TCM Innovative Databases

中药方剂、单体药、活性化合物

TCM Prescription, Medicinal Herb, Structure of Bioactive Compound

 

中国天然药物资源库(在开发中)

单体药、活性化合物

Medicinal Herb, Structure of Bioactive Compound

 

中药活性成分数据库

Bioactive Ingredient Database

活性化合物结构

Structure of Bioactive Compound

中药方剂检索

TCM Prescription Search

中药创新数据库

TCM Innovative Databases

中药方剂、单体药、活性化合物

TCM Prescription, Medicinal Herb, Structure of Bioactive Compound

先导结构生成与优化

 

Generation & Optimization of Lead Structures

药效团结构

Structure of Pharmacophore

自动生成小分子结构Generation of Ligands

CISOC-VCSG

虚拟活性化合物结构

活性化合物结构

Structures of Virtual bioactive Compounds, Structures of bioactive Compounds

3D数据库检索

3D Structure Search

CISOC-NewCom_3D

组合库设计

 

Design of Combinatorial Library

疾病

Diseases

基于中药知识的组合库设计

Design of Combinatorial Library based on TCM Knowledge

中药创新数据库
TCM-Based Reverse Combinatorial Library

核心结构(Scaffold)

核心结构

Scaffold

寻找最佳反应序列或反应规程

Search for Reaction Sequence or Reaction Protocol

CISOC-REACT

CISOC-GRKB

CISOC-RetroSYN

前体反应物(Precursors)

虚拟组合化学库(Virtual Combinatorial Library)

合成设计

 

Synthesis Design

活性化合物结构

 Bioactive Compounds

特定反应检索

Reaction Database

CISOC-REACT

反应

Reactions

同类反应检索

Generic Reaction Knowledge Base

CISOC-GRKB

同类反应

Generic Reactions

反合成分析

Retro-synthetical Analysis

CISOC-RetroSYN

合成树

Synthesis Tree

需要更进一步的介绍可通过下述地址与我们联系:

    联 系 人:姚建华
    联系单位:中国科学院上海有机化学研究所
              计算机化学和化学信息学研究室
    联系地址:上海市枫林路354号 
    邮政编码:200032
    联系电话:+86-21-54925266, +86-21-54925264
    传真FAX+86-21-54925264
 

(更新时间:2017-04-20 11:28:12)


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